نخستین کارگاه آموزشی بیوانفورماتیک

: آرسام فرا زیست

کارگاه آموزشی بیوانفورماتیک

(تئوری و عملی)

ضرورت کارگاه

امروزه به دلیل پیشرفت های گسترده در زمینه تکنیک ها و ابرازهای مورد نیاز در حوزه علوم زیستی، روزانه حجم وسیعی از اطلاعات در زمینه های مختلف بیولوژی تولید می شود. داده هاي بيولوژيکي با سرعت بسيار بالائي توليد مي شوند به عنوان مثال تا سال 2019 بانک ژن 1314392880رکورد و بانک پروتئين، 156924 رکورد ذخيره کرده اند. به طور میانگین این داده ها هر 15 ماه 2 برابر میشوند. از زمان انتشار ژنوم H. influenza تا سال 2001 توالی کامل 300 جاندار منتشر شده است. این توالیها بین 450 تا بیش از 10000 ژن دارند. به علاوه داده های حاصل از پروتئین های مرتبط مانند بیان ژنی و تعیین ساختار پروتئین ها را نیز باید در نظر گرفت. به دلیل وجود چنین حجم دادهای، لزوم استفاده از کامپیوترها در تحقیقات بیولوژیکی مشهود است.

بیوانفورماتیک کاربرد روش های محاسباتی به منظور فهم و سازمان دهی اطلاعات مربوط به درشت مولکول های بیولوژیکی است. به طور کلی بیوانفورماتیک سه هدف عمده را دنبال میکند:

اول بیوانفورماتیک داده ها را به گونه ای سازماندهی میکند که محققان بتوانند به اطلاعات موجود دسترسی داشته باشند و نیز نتایج جدید را ارسال نمایند.

دوم توسعه ابزارهایی برای کمک به تحلیل این داده هاست. مثالی از این تحلیل داده ها، مقایسه توالی یک پروتئین با دیگر پروتئین ها است. توسعه چنین ابزارهایی نیازمند تخصص در زمینه محاسبات و فهم عمیق بیولوژیکی است.

سوم استفاده از این ابزارها برای تحلیل داده ها و تفسیر نتایج به صورتی است که از نظر بیولوژیکی با معنا باشد. در گذشته مطالعات زیستی سیستمها به طور مجزا بررسی میکرد. در بیوانفورماتیک می توان کل داده های موجود را با هدف کشف قوانین جاری در سیستم ها تحلیل نمود.

مخاطبین کارگاه

با توجه به اهمیت بیوانفورماتیک در رشتههای علوم زیستی، دامپزشکی، پزشکی و کشاورزی، کارگاه آموزشی تحت عنوان بیوانفورماتیک بامحورهای زیر توسط تیم علمی آرسام فرازیست و با همکاری انجمن تحقیقات آزمایشگاهی و آزمایشگاه مرکزی دانشگاه ارومیه در تاریخ 23 آبان ماه 1398 برگزار خواهد شد. تمامی مطالب محورهای کارگاه، ابتدا بصورت تئوری توضیح داده خواهد شد و سپس بصورت عملی (تمرین) به شرکت کنندگان منتقل خواهد شد.

محورهای کارگاه

مقدمه ای بر بیوانفورماتیک، بیوانفورماتیک و رابطه آن با زیست مولکولی، کاربردهای بیوانفورماتیک
آشنایی با پایگاه‌های اولیه توالی نوکلئیک اسید و پروتئین (GenBank, EMBL, DDBJ, PDB, NCBI, EBI, TIGR, SANGER)
آشنایی با پایگاههای ثانویه (Swiss-prot, TrEMBL, PIR, Uniprot, Prosite)
آشنایی با پایگاه مسیرهای بیوسنتزی متابولیت‌های ثانویه Kegg
آموزش انواع Blast و کاربردهای مربوطه
هم‌ردیفی توالیهای ژنی و پروتئینی
بررسی تغییرات پس از ترجمه پروتئین، آنزیم و فاکتورهای رونویسی
شناسایی پروموتور و MicroRNAها

نحوه ثبت نام

هزینه ثبت نام این دوره از کارگاه که شامل هزینه ثبت نام دوره، پذیرایی و ناهار می باشد برای دانشجویان دانشگاه ارومیه: 260000 تومان و سایر شرکت کننده ها: 350000 تومان می باشد.

جهت ثبت نام مبلغ فوق را به شماره کارت: 6037-9975-9906-1802 به نام آرسام فرا زیست اسپوتا، بانک ملی

و یا شماره کارت:6219-8610-1971-8955 به نام روح ا... ملکی، بانک سامان واریز و تصویر آن را به همراه نام و نام خانوادگی به شماره 09020115860 تلگرام یا واتساپ نمایید. لازم به ذکر است دانشجویان دانشگاه ارومیه تصویر کارت دانشجویی خود را نیز ارسال نمایند.

نکته: همراه داشتن لپ تاپ برای شرکت کننده ها (حداقل یک دستگاه لپ تاپ برای دو نفر) الزامی است.